DNAMAN手机软件是一款专业的微生物新信息软件,DNAMAN可以用以多序列核对、PCR 引物设计方案、约束性酶切分析、质粒制图、蛋白分析等,基本上涵盖了全部日常核苷酸、蛋白序列的分析工作中。DNAMAN内嵌图型分析,您可以将自身的研究数据信息公布到手机软件上,运用全自动统计分析及其数据图表作用得到详尽的数字行情分析,为以后的实验给予必要的参照数据信息。
2个引物相辅相成
您可以应用DNAMAN查验2个寡核苷酸序列的多样性。 要实行此作用,第二个引物应根据挑选引物|加载DNAMAN储存器 2个Primer相辅相成指令。
DNAMAN检索2个引物中间的相辅相成序列。 结果显示2个引物中间的持续和不持续的相辅相成序列。
PCR引物设计方案
您可以应用DNAMAN挑选达到您增加模版DNA规定的PCR引物。 设计方案了很多主要参数来挑选PCR引物,比如PCR物质尺寸,引物长短,Tm,GC构成和含盐量的范畴。 别的主要参数用以清除“低品质”引物。
导进和导出来纪录
从文本文档导进纪录
从文本文档导进寡核苷酸序列是将很多oligo记录加上到数据库查询的方便快捷专用工具。
DNAMAN将纪录的信息内容纳入七个字段:名字,来源于,备注名称,长短,GC成分,融解溫度和序列。假如数据库查询中有很多纪录,则可以选择前四个字段做为排列键,便于在“纪录列表”框中可选择性地表明纪录。
导向性不配对
定项失衡可以利用在基因突变周边的结构域引进一次或双向失衡来建立或除去当今DNA序列或其组合上的约束性结构域。 应用此作用,您可以建立或毁坏约束性结构域,以区别野生型等位基因与普遍突变体等位基因。
DNAman如何分析序列的酶切结构域:
将待分析的序列装进Channel,点一下要分析的Channel,随后根据Restriction/Analysis 指令开启提示框.主要参数表明如下所示:Results 分析数据显示在其中包含:Show summary(表明概述) Show sites on sequence(在結果中表明酶切结构域)Draw restriction map(表明约束性酶切图)Draw restriction pattern(表明约束性酶切示意图)Ignore enzymes with more than(忽视超过某预设值的酶切结构域)Ignore enzymes with less than(忽视低于某预设值的酶切结构域)Target DNA (总体目标DNA 特点)circular(环形DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化)主要参数表明如下所示:Enzyme意味着(enzyme data file),点一下边上的点击按键,发生2个默认设置选择项,restrict.enz 和dnamane.enz,假如加上过自做的酶列表,则额外表明自做酶列表文件夹名称.在其中restrict.enz 数据库文件包括180 种限制酶,dnamane.enz 数据库文件包括2524 种限制酶.挑选在其中一个数据库文件,相对应的酶在左边的 表明框中列举(按酶名字字母表顺序),鼠标双击酶名字,则相应的酶被选定,在右侧空缺框中列 出.要自做酶切列表,可以从左侧酶列表中双击鼠标挑选多种多样酶(比如puc18 multiple cloning sites),随后点一下按键发生以下提示框:键入要储存酶列表的文件夹名称,点一下按键就可以储存.自做酶列表可以便捷分析特殊的酶切结构域.Cutter 酶切鉴别序列长短;End 酶切造成的尾端,在其中包含,Blunt(小平头尾端),5’Overhang(5’突显粘性末端),3’Overhang(3’突显粘性末端),系统软件依据cutter 和end 的设置状况,在左边酶列表 中表明满足条件的酶.最终,点一下按键实行实际操作.
怎么使用DNAMAN制作软件序列核对图
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